وصف الخدمة

سأقوم بتنفيذ Molecular Docking باستخدام AutoDock Vina لمركب واحد مع بروتين واحد. تشمل الخدمة تجهيز ملفات البروتين واللجيند بصيغة PDBQT، وتشغيل AutoDock Vina مرة واحدة لإنتاج 10 وضعيات ارتباط مع قيمة Binding affinity لكل وضعية. يتم تسليم الملفات الأصلية (output + poses)، وصورتان توضيحيتان (3D و2D)، بالإضافة إلى تقرير PDF من صفحتين يوضح أفضل وضعية وأفضل قيمة للارتباط مع شرح مبسط. الخدمة الأساسية تشمل تشغيل واحد وتحليل واحد فقط.

مميزات الخدمة

. تحليل Docking احترافي باستخدام AutoDock Vina

يتم إجراء docking دقيق باستخدام أداة AutoDock Vina لاختيار أفضل موضع ارتباط (binding pose) وأكثرها استقراراً للطبيعة الكيميائية للمركب مع الهدف البيولوجي.

وفير 3D و2D visualization للتفاعل

ستحصل على صور توضيحية ثلاثية الأبعاد وثنائية الأبعاد للتفاعل بين المركب والمستقبل، مما يساعدك في فهم التفاعل بسهولة.

شرح تفصيلي باللغة العربية والإنجليزية

نتائج دقينوفر تقريرًا مبسطًا وشاملًا يوضح النتائج، والتفسير العلمي للتفاعل، مكتوب بلغتين لتناسب النشر أو التقديم الأكاديمي.

معرض الأعمال

ما الذي ستستلمه

ما الذي سأحصل عليه في نهاية الخدمة؟

ما الذي ستستلمه مقابل الخدمة الأساسية:

ملفات الإدخال والإخراج الأصلية: ملف البروتين وملف اللجيند بصيغة PDBQT، وملفات الـ log، وposes.

صور توضيحية: صورة ثلاثية الأبعاد (3D) توضح أفضل وضعية داخل الموقع النشط، وصورة ثنائية الأبعاد (2D) توضّح الروابط الهيدروجينية والتفاعلات داخل الجيب الفعال.

تقرير PDF: صفحتين يوضحان أفضل وضعية وأفضل قيمة للارتباط مع شرح علمي مبسط، ويحتوي جدول واحد يوضح قيم الـ Binding affinity لجميع الوضعيات العشر الناتجة عن التحليل.

الخدمة الأساسية تشمل مركب واحد، بروتين واحد، تحليل واحد فقط.